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疫情66天,全球190篇論文解碼新冠病毒

每日經濟新聞 2020-03-04 09:29:39

每經記者 蘭素英 余佩穎 文巧 張凌霄    每經編輯 蘭素英    

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圖片來源:每經制圖

近日,新冠肺炎疫情在全球持續蔓延。當地時間2月26日,世衛組織總干事譚德塞在日內瓦表示,25日中國境外上報的新冠肺炎新增病例數首次超過中國境內新增病例數,目前意大利、伊朗、韓國的情況令人十分擔憂。

面對疫情,學術界以最快速度加入了這場沒有硝煙的“戰場”。《新英格蘭醫學雜志》(The New England Journal of Medicine)、《柳葉刀》(The Lancet)等世界級著名醫學雜志還單獨為新冠肺炎開設了專欄。

據《每日經濟新聞》記者不完全統計,從12月26日至3月1日,來自中國疾病預防控制中心文獻目錄以及全球權威醫學期刊的各類新冠病毒的研究文章共計190篇,身在全球抗疫一線的中國醫學研究者是發稿的主要力量,其中115篇出自中國研究團隊,占61%。

面對醫學界在學術領域的積極發文,國內質疑聲不斷:在重大公共衛生事件面前,是否該著急搶發論文?究竟是科研重要,還是疫情防控重要?

“疫情防控有兩條主線,一是防控和診治,二是科學研究。中國工程院副院長、中國醫學科學院院長王辰此前接受采訪時表示。從病毒溯源、病原檢測、基因測序,到藥物試驗、疫苗開發,抗“疫”既是人類同病毒的殊死較量,也是科研與疫情的激烈搏斗。

 “科學及醫學研究在理解這一新型冠狀病毒及與之相關的呼吸系統疾病方面發揮著至關重要的作用,同時也有助于尋求解決方案以遏制其蔓延。“全球最權威的學術期刊之一《自然》(Nature)的總編輯瑪格達琳娜·斯凱珀(Magdalena Skipper)在接受《每日經濟新聞》記者采訪時表示。

學術抗疫:66天,139篇原創論文

隨著對疫情及病例的不斷研究,國內外學者發表的關于新冠病毒的論文也在日益增多。在接受《每日經濟新聞》記者采訪時,頂級醫學期刊《新英格蘭醫學雜志》表示,“鑒于目前的疫情,我們已經加快論文發表的進程,從提交到發布的時間短達48小時。

打響這場科學抗疫之戰的第一槍要追溯至1月中上旬。彼時,中國疾控中心、中國醫學科學院以及中國科學院三方均在掌握到新型冠狀病毒全基因組序列后,向世界衛生組織提交了病毒序列,且在全球流感共享數據庫(GISAID,Global Initiative on Sharing All Influenza Data)發布。

自此之后,這一神秘的病毒開始在科學家的顯微鏡下逐漸顯形。據《每日經濟新聞》不完全統計,截至3月1日,各類新冠病毒的研究文章共計190篇。

值得注意的是,這190篇文章并非都屬原創論文,其中有27%的通訊文章和新聞等其他類稿件,而原創論文共計139篇,占比達73%。

通常,原創論文的內容需包含研究假設、研究背景、研究方法、研究結果、研究發現解釋和討論可能的含義,發稿要求較高。

在具體的研究方向上,根據世界衛生組織此前劃分的九大重點,即新冠病毒的自然史、傳播模式和診斷方法;識別動物宿主;流行病學研究;臨床特征和管理;疫情防控;候選療法的研發;候選疫苗的研發;倫理評估;應對疫情相關的社會科學層面諸多問題的潛在驅動因素來看,以“新冠病毒的自然史,傳播模式和診斷方法”這一研究方向最為熱門,共計發稿38篇,占比27%;其次是“流行病學研究”,發稿33篇,占比24%;位列第三的是“臨床特征和管理”,發稿30篇,占比21.6%。

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圖片來源:每經制圖

在這一系列研究成果名錄之下,有武漢金銀潭醫院全球首發的新冠肺炎患者的臨床研究論文,有香港大學團隊基于家庭發病案例研究得出新冠病毒人傳人的事實,有美國華盛頓州衛生部公共衛生實驗室首發的在患者糞便中檢測到新冠病毒的研究,還有武漢病毒研究所石正麗團隊和香港大學管軼團隊在鍥而不舍地追溯新冠病毒的宿主……

“有關研究及成果預計在今年及之后會出現激增,“《自然》總編輯斯凱珀對《每日經濟新聞》記者表示。 

預印本平臺:科研文獻最快發布的主戰場

據《每日經濟新聞》梳理的文章發布平臺看,除了廣為人知的《柳葉刀》外,bioRxiv和medRxiv的發稿量最大,合占總稿量的45%。其次是《柳葉刀》,占比23%,隨后是《新英格蘭醫學雜志》,占5%,《自然》排名第四,占比4%。

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圖片來源:每經制圖

bioRxiv和medRxiv屬于預印本網站,均由大名鼎鼎的冷泉港實驗室(The Cold Spring Harbor Laboratory,縮寫CSHL)創立。CSHL被稱為世界生命科學的圣地與分子生物學的搖籃,在該研究所一共誕生了8位諾貝爾獎得主。

預印本網站是儲存及發布醫學類學術論文的平臺,預印本指的是在同行評審前就公開分享的科研論文手稿。同行評審是現代學術交流的基石,被公認為是科技期刊判別研究論文的科學價值和保障文章學術質量的重要手段。

發表在預印本平臺的文章同時可以提交給學術期刊,經過專業人員進行相關學術及非學術審查(如抄襲、明顯錯誤等)后,便可作為正式文章發表。

跟預印本平臺不同,《柳葉刀》這類著名期刊就像是“精英俱樂部”,發稿要求自然也很高。按照慣例,在《新英格蘭醫學雜志》發表論文,從提交到正式發布,至少需要兩周時間。

《柳葉刀》與《新英格蘭醫學雜志》、《美國醫學期刊》(The Journal of the American Medical Association)和《英國醫學期刊》(British Medical Journal)并稱為歷史最悠久的四大綜合性醫學學術期刊之一。

根據2019年6月20日發布的2018年SCI學術期刊影響因子,《柳葉刀》排名第四,影響力因子為59.102,位于《新英格蘭醫學雜志》之后,后者影響力因子為70.67。《美國醫學會雜志》以 51.273 的影響因子排名第九。《Nature》排名第13位,影響因子為43.07。《英國醫學雜志》排名38位,影響因子為27.604。bioRxiv等預印本網站不屬于期刊,因此沒有影響因子。

SCI 外文期刊影響因子每年六月份由湯森路透(Thomson Reuters)旗下數據庫 Web of Science中的《期刊引用報告》(Journal Citation Reports)發布。期刊的影響因子,指的是該刊前兩年發表的文獻在當前年的平均被引用次數。一種刊物的影響因子越高,也即其刊載的文獻被引用率越高,一方面說明這些文獻報道的研究成果影響力大,另一方面也反映該刊物的學術水平高。

研究文章一旦在期刊上登載出來,就屬于“完成時”,原則上除了允許對個別文字進行刊誤外,文本內容和數據是不能更改的。預印本則處于可以被不停修改其內容和數據的“進行時”發布狀態,在期刊正式接受文章之前,作者可以隨時通過點擊作者區域內的“提交修訂”來提交文章的修訂版本,就如同計算機程序一樣,從初稿發表之日起可以被陸續“迭代”更為完善的版本。

“在開放的科學平臺上,應該更多地共享研究成果,而不必等待出版。澳洲皇家病理科醫學院榮授院士、香港大學病理學系臨床醫學教授黎國思(John M Nicholls)向《每日經濟新聞》記者說道。黎國思教授曾在《柳葉刀》期刊發表有關SARS的解剖病理學研究論文。

為促進學術交流,加快科研成果傳播,權威學術期刊如《自然》也發布了明確的預印本政策。“自新型冠狀病毒暴發以來,我們便要求作者在向我們期刊提交與此次疫情相關的稿件時,盡可能快速和廣泛地分享期中和最終的基礎數據集,包括與公共衛生機構、研究機構及世界衛生組織進行分享,并將論文稿件存儲在預印本服務器上。”《自然》總編輯斯凱珀向《每日經濟新聞》記者解釋道。

世衛組織:科研成果助力抗疫

中國科學院院士趙國屏在接受媒體采訪時曾表示,在一個新型流行病暴發的初期,很多論文是預防醫學的流行病學總結或臨床醫學的病例總結。這對實時實地的疾病防控與診治有直接的指導或參考價值,是非常需要及時開展交流的。

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圖片來源:攝圖網

“新的科研成果以及在SARS和MERS等疫情中積累的知識和經驗,為抗擊疫情提供了支持。中國是疫情暴發的中心,因此,來自中國科學家的科研報告將是無價的。”世界衛生組織在接受《每日經濟新聞》記者采訪時說道。

1月30日,世界衛生組織將新冠疫情列為國際關注的突發公共衛生事件。在疫情趨勢越發嚴峻的情況下,為了打贏這場“抗疫戰“,如何保障新冠病毒的信息能夠通暢、快速共享,是對抗疫情的努力中不可缺少的一部分。

“信息是疫情防控的關鍵,”2月1日,《柳葉刀》在一篇評論文章中肯定了科學研究在公共衛生應對措施中的重要地位,“中國科學界反應迅速,實時調查和報告疫情,提供重要的公共衛生、臨床和病毒學數據來指導中國和全球應對疫情。”

以解剖病理研究為例。2月17日,《柳葉刀》發表了首份新冠肺炎病理學報告,研究團隊來自解放軍總醫院第五醫學中心。該研究基于患者死亡后的微創病理檢查,結果顯示,新冠肺炎的病理特征與SARS和MERS非常相似。

“這意味著,新冠病毒與SARS和MERS病毒有相同的攻擊目標,即用于氣體交換的肺泡細胞。新冠病毒致死的主要原因是肺部損傷,但更重要的是弄清死因到底是病毒引起的主要損害,還是機體對病毒的過度反應引起的變化(如彌漫性肺泡損害),亦或是使用類固醇引起的繼發性細菌感染,”黎國思(John M Nicholls)教授告訴《每日經濟新聞》記者。

這對于病毒檢測和新冠肺炎的臨床治療具有十分重要的意義。“如果損害是由機體對病毒的反應引起的,這將影響治療的選擇,“黎教授解釋道。

“進行病毒培養也是很重要的一步,可以觀察到病毒在體內存在多長時間、患者是否產生相應的抗體,”他進一步表示,“如果在解剖時(假設生病后7天)未發現有殘留活性病毒,則意味著在臨床治療中對生病超過7天的患者不必使用抗病毒藥物。“

與此同時,有關新冠病毒的病毒學研究也為疫苗的研發奠定了堅實的基礎。

2月10日,澳大利亞新南威爾士州的研究人員宣布成功培養出基于患者病毒樣本的活病毒,且已經能夠構建該病毒的兩個完整基因組序列。在新南威爾士州衛生部公共衛生病理學主任多米尼克•德威爾(Dominic Dwyer)看來,這除了能幫助進行病毒測試外,還能推進疫苗研發。

2月19日,知名學術期刊《科學》發表了一篇論文,來自美國得克薩斯大學奧斯汀分校的McLellan實驗室團隊首次利用冷凍電鏡展示了新冠病毒刺突蛋白的3D分子結構,再度確認刺突蛋白結構是疫苗應對的關鍵區域。

“知道了病毒背后的機制就能更好地指導疫苗研發。”該實驗團隊的分子生物學博士Wang Nianshuang告訴《每日經濟新聞》記者。“我們正在使用一種稱為‘基于結構的疫苗設計’方案來研發更好的疫苗。現在已經獲得了性能良好的新冠病毒刺突蛋白和3D結構,基于這個結構可以進一步設計和改造該刺突蛋白以取得品質更優的疫苗。”Wang Nianshuang博士也是該論文的主要作者之一。

紐約大學生物學、神經科學教授卡羅爾•肖克斯•賴斯(Carol Shoshkes Reiss)也對記者表示,“科研透明性有助于全世界的科學家和臨床醫生了解新冠病毒以對抗疫情。

事實上,新冠病毒肺炎研究進行至今,全球科學家都在竭盡全力探尋這一新型病毒的真實面貌和應對疫情的有效手段。越是在這種緊要關頭,傳遞正確的信息越是馬虎不得。

在國際頂級醫學期刊《新英格蘭醫學雜志》于2月27日發表的一份音頻文件中,該雜志執行主編斯蒂芬•莫里西(Stephen Morrissey)就認為,如果并未處于衛生緊急事件且時間充裕的情況下,嚴格審閱、編輯論文非常重要,這樣才能確保醫生和公眾看到的信息是可靠的,而遇到新冠肺炎的緊急情況,需要要加快速度。“但是,我們不可能做到每一篇論文都能如此之快。”

在該雜志責任編輯林賽•巴登(Lindsey Baden)博士看來,在緊張的氛圍當中,如何傳遞正確的信息非常重要。他認為,當前很多心懷善意的科研者做出了許多觀察報告,但是并不是所有的都是正確的。“當前我們都很擔心疫情,這意味著我們更要非常小心地傳達信息,以公平和平衡的方式幫助公眾了解實情。需要相當多的努力才能找到最佳的速度和平衡。”

莫里西博士鼓勵論文作者及時跟當地的衛生部門分享他們的信息,還可以先在預印本網站發表他們的發現。“《新英格蘭醫學雜志》也會加快審閱和發布的速度。”他補充道。

記者手記丨66天的139篇原創論文僅是新冠研究的開始

科普同樣任重道遠

權威醫學期刊上刊載的外語論文因其大量的專業術語,復雜的計算模型,繁瑣的實驗過程而顯得曲高和寡,然而一場疫情的到來讓這些期刊以及論文走進了平常人家的生活,成為屢次占據社交媒體的話題詞。借由媒體、意見領袖的傳播,這些小眾的“期刊論文”開始展現科普力量,當家人轉發了一篇《柳葉刀》刊載的新冠研究成果給我時,那一刻感覺朋友圈養生文好像已戰敗,科普時代已到來。

然而當疫情發展的時間線,封城后武漢推行各項措施的時間線在讀者中廣為流傳之時,對新冠病毒肺炎科學研究發展的時間線卻未見蹤影。同時,那些質疑研究者在疫情蔓延期間搶發論文的聲音并未消停。

在梳理這篇報道的材料時,那些生僻的外文詞匯帶來了巨大的閱讀障礙,讓我們三幾位記者幾次在深夜時分感到崩潰。可是當我們走進這些論文后,當連線這些期刊或者背后的發文團隊后,當我們將科學研究與疫情發展加以聯系后,深知這場抗疫之戰最終勝利的軍功章上一定有這些科學家的名字。多位科學家告訴記者,疫苗研究正晝夜不歇地進行中,現在還僅是開始。

記者:蘭素英  余佩穎  文巧  張凌霄

編輯:蘭素英

視覺:蔡沛君

排版:蘭素英 盧祥勇

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最新評論(1)
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    捂耳聽風 2020-03-05 13:39:48

    科普理論與實踐想要轉發您這篇文章。

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